文学研究院设置有真宗学、佛教学、哲学、教育学、国史学、东洋史学、日本语日本文学、英语英美文学等8个专业，各自还设有硕士课程和博士后期课程。
在各专业中，利用龙谷大学引以为豪的贵重资料等进行着研究，并在各领域开展最新研究的教师，强有力地支援学生的研究活动。此外，还积极地接收外国留学生，并应对于社会人和教育相关人员的再教育、终生教育等多种学习需求。
此外，在文学研究科教育学科临床心理学领域，从2004年4月起，开设了临床心理士课程，并从2008年4月起被认定为第1种指定校。