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概要
 耳や鼻といった動物の感覚器官を顕微鏡で覗くと、数種類の細胞が作る規則正しい幾何学的な模様が現れます。この規則的な細胞パターンが、外界からの刺激を感知する上で重要な役割を果たしていると考えられています。しかし、細胞がどのように安定的にパターンを作り出すことができるのか、その仕組みについてまだ謎が多く残されています。この謎に対し、神戸大学大学院医学研究科 富樫英 助教の研究グループはこれまでに行った実験から、細胞タイプによって細胞間に働く接着力の違いが生じ、この接着力の違いによりパターンが作られるのではないか、という仮説を立てました。そこで、京都大学大学院理学研究科 カレル・シュワドレンカ准教授、ルダイナ・モハマド同研究員(現:フィリピン大学助教)と龍谷大学先端理工学部 村川秀樹 准教授の数学研究グループは、この仮説を数理的に検証することを試みました。細胞パターン形成の過程を記述する新しい数理モデルを創出し、計算機上でシミュレーションをするための数値計算手法を開発しました。実際の測定値に基づいた数値シミュレーションの結果、感覚器で見られる細胞パターンを再現することに成功しました。感覚細胞のパターン形成メカニズムが解明され、感覚障害等の疾病の治療にも役立つかもしれません。
 本成果は、2022年3月18日に国際学術誌Communications Biologyにオンライン掲載されました。


(上段)マウスの嗅上皮の胎生14日目から生後1日目にかけての細胞パターンの変化。小さな細胞は嗅細胞、大きい細胞は支持細胞(撮影:神戸大学 富樫英)
(下段)接着力を示す実験測定値を一部用いて行われた数値シミュレーションの結果。

 

1.背景
 動物が音や匂いを感じるための感覚器官の上皮では2種類の細胞が規則正しく幾何学的に並んでいます。感覚を司る感覚細胞がそれを支える支持細胞によって囲まれることで感覚細胞が等間隔に並ぶモザイクパターンがつくられます.感覚器が正しく働くためには,規則正しく並ぶことが重要なのですが、細胞がどのようにして感覚機能に適したパターンを安定的に作り出すのか、まだ完全にはわかっていません。そのメカニズムの解明は、形態形成を理解する上で発生・細胞生物学分野の重要な課題とされています。感覚細胞と支持細胞では発現する接着分子の種類が異なり、細胞間の接着力の違いでモザイクパターンがつくられる可能性が高いということが、神戸大学大学院医学研究科 富樫英 助教の研究グループらがこれまでに行なった実験から示唆していましたが、細胞間の接着力の違いのみでパターン形成が説明できるかについては不明でした。そこで、富樫助教と共同研究を行なっていた龍谷大学先端理工学部 村川秀樹 准教授は、界面運動の数値計算手法について研究している京都大学大学院理学研究科カレル・シュワドレンカ准教授とルダイナ・モハマド同研究員(研究当時、現:フィリピン大学助教)に声をかけ、生物学と数学の連携によりこの課題に挑む研究プロジェクトが発足しました。

2.研究手法・成果
 研究グループは、細胞の形態形成をシャボン玉のような物理現象と関連付けて考えることから始めました。2つのシャボン玉が接している場合、2つのシャボン玉の間の膜上の界面張力が弱ければ接着面の面積は大きくなり、界面張力が強ければ小さくなるでしょう。そこで、実際の細胞において、単独では丸くなろうとする2つの細胞が接している状況を考えます。2つの細胞間の接着力が強ければシャボン玉と同じ様に2つの細胞が接している接着面の面積は大きくなり、接着力が弱ければ小さくなるでしょう。研究グループは、細胞間接着力と界面張力には逆の相関があると考え、細胞の形態やパターンの変化を界面張力の変化により表現する方法を考えました。この場合、界面張力は接着力のみでなく、細胞膜の収縮や膨圧などを含む力の総和として表現されます。このように考えることで、界面張力のみをパラメーターとして持つ非常にシンプルな数理モデルを創出することが出来ました。数理モデルがシンプルであるからと言って、容易に数値シミュレーションができるとは限りません。本研究では、数理モデルの提案と共に数値シミュレーションのための数値計算手法の開発も行いました。細胞再配列のシミュレーションに一般的に使われてきたvertex dynamics1などの計算手法では数理モデルの十分に正確な解が得られないため、数値計算手法の開発も研究の重要なステップでした。細胞の複雑な形態を表現することを可能にするレベルセット法2、細胞の体積を保存させるauction dynamics3アルゴリズム、そして細胞の不自然な分裂を避けるための局所化アルゴリズムを組み合わせることで,正確な数値シミュレーションができるようになりました。マウスの嗅上皮と聴覚上皮のサンプルから、ある接着分子の濃度を測定して、細胞同士の接着力を評価しました。この値を数理モデルのパラメーター(「界面張力」=「接着力の逆数」として)に入力して、数値シミュレーションを行ったところ、実際に観察される細胞パターンを見事に再現することができました。このことは、感覚細胞の規則的なパターンの形成において界面張力の違いと変化が最も重要な要因であることを強く裏付けています。また、本研究を通して、細胞間接着力の違いのみでは説明が付かない細胞パターンについても界面張力の違いにより説明ができる場合があることが分かり、今後の研究の発展が見込めます。研究の最初の着眼点は「細胞間の接着力の違い」でしたが、シミュレーションの結果からは「細胞間の界面張力の違い」が細胞パターン形成に最も重要であるという結論に至りました。

3.波及効果、今後の予定
 生物学の最先端のイメージング技術に数学解析の最新結果を組み合わせることで、感覚器官における細胞パターンの形成では細胞間の界面張力の違いが重要な要素であることを示し、発生生物学の基本的な疑問の一つに答えを出すことができました。これは基礎科学の成果ですが、感覚器官の形成メカニズムの解明につながり、最終的には様々な疾病の治療法の開発にもつながると期待しています。さらに、今回構築した新しい数値計算手法を計算ライブラリーに実装し、一般に公開していますので、他の生物学の諸問題の解決に役立つことにも期待しています。
 本研究では、細胞間接着力、細胞膜の収縮、膨圧などの力の総和として界面張力を考えています。これらの関係性については一部実験により示唆があるものの、はっきりした定量的な関係性は分かっていません。それらの関係性を調べるための理論や計測手法の開発が次の課題です。

4.研究プロジェクトについて
 本研究はJSPS科研費(課題番号19K03634, 19H04965, 18H04764, 18H05481, 18K06219, 18H01139, 20H01823)、JSPS特別研究員奨励費(課題番号18F18016)、JSTさきがけ(課題番号JPMJPR1946)の助成を受けたものです。データサンプリングでは勝沼紗矢香博士(兵庫県立こども病院 耳鼻咽喉科)、プログラミングではAdrien Rey氏(ソルボンヌ大学)のご協力をいただきました。

<用語解説>
1 vertex dynamics:それぞれの細胞を多角形で近似し、多角形の頂点をエネルギーが減る方向に動かすことで細胞の変形を表す方法
2 レベルセット法:細胞の形状をある関数のグラフの等高線(等高面)として表現し、この関数に対する適切な発展方程式を解くことで、等高線(細胞)の変形を実現する方法
3 auction dynamics:オークションを模擬することで、界面の囲う領域の体積の保存を実現する計算アルゴリズム

<研究者のコメント>
 実験室で実物の生き物を扱う生物学者と抽象的な概念を扱う数学者が協力することで、それぞれの分野では単独では得られなかった発見ができて、分野を超えた共同研究は有意義でわくわくするものだと感じました。(K. Svadlenka)

<論文タイトルと著者>
タイトル:A numerical algorithm for modeling cellular rearrangements in tissue morphogenesis(和訳:組織形態形成における細胞配列をモデリングするための数値アルゴリズム)
著  者:Rhudaina Z. Mohammad, Hideki Murakawa, Karel Svadlenka, Hideru Togashi
掲 載 誌:Communications Biology DOI:10.1038/s42003-022-03174-6

<お問い合わせ先> 
SVADLENKA Karel(シュワドレンカ カレル)/ 京都大学理学研究科数学教室・准教授
E-mail:
karel@math.kyoto-u.ac.jp


<報道・取材に関するお問い合わせ先>
京都大学 総務部広報課国際広報室
TEL:075-753-5729 FAX:075-753-2094
E-mail:
comms@mail2.adm.kyoto-u.ac.jp

神戸大学 総務部広報課
TEL:078-803-5453  
E-mail:
ppr-kouhoushitsu@office.kobe-u.ac.jp

龍谷大学 研究部(瀬田)
Tel:077-543-7548
E-mail:
setaken@ad.ryukoku.ac.jp

<参考図表>
嗅上皮の数値シミュレーションの動画    
https://youtu.be/clH7-l4K7AU
嗅上皮でみられる細胞パターン形成の数値シミュレーション。左側は野生型マウスの接着分子の濃度測定値を用いた計算、右側はαN-カテニンという接着分子を阻害して、細胞間の接着力を変化させたときのシミュレーションで、いずれも実際に観察される細胞パターンを再現することが出来ています。


 耳や鼻といった動物の感覚器官を顕微鏡で覗くと、数種類の細胞が作る規則正しい幾何学的な模様が現れます。この規則的な細胞パターンが、外界からの刺激を感知する上で重要な役割を果たしていると考えられています。しかし、細胞がどのように安定的にパターンを作り出すことができるのか、その仕組みについてまだ謎が多く残されています。この謎に対し、神戸大学大学院医学研究科 富樫英 助教の研究グループはこれまでに行った実験から、細胞タイプによって細胞間に働く接着力の違いが生じ、この接着力の違いによりパターンが作られるのではないか、という仮説を立てました。そこで、京都大学大学院理学研究科 カレル・シュワドレンカ准教授、ルダイナ・モハマド同研究員(現:フィリピン大学助教)と本学先端理工学部 村川秀樹 准教授の数学研究グループは、この仮説を数理的に検証することを試みました。細胞パターン形成の過程を記述する新しい数理モデルを創出し、計算機上でシミュレーションをするための数値計算手法を開発しました。実際の測定値に基づいた数値シミュレーションの結果、感覚器で見られる細胞パターンを再現することに成功しました。感覚細胞のパターン形成メカニズムが解明され、感覚障害等の疾病の治療にも役立つかもしれません。

 本成果は、2022年3月18日に国際学術誌Communications Biologyにオンライン掲載されました。

※詳細はプレスリリースをご確認ください。 

 

<論文タイトルと著者>

掲 載 誌:

 Communications Biology  ※Nature Portfolioのオープンアクセスジャーナル

 (インパクトファクター:5.489)

 

タイトル:

 A numerical algorithm for modeling cellular rearrangements in tissue morphogenesis

 (組織形態形成における細胞配列をモデリングするための数値アルゴリズム)

 

著 者 :

 ルダイナ・モハマド(フィリピン大学 助教)

 村川 秀樹(龍谷大学先端理工学部 准教授)

 カレル・シュワドレンカ(京都大学大学院理学研究科 准教授)

 富樫 英(神戸大学大学院医学研究科 助教)

 


(上段)マウスの嗅上皮の胎生14日目から生後1日目にかけての細胞パターンの変化。小さな細胞は嗅細胞、大きい細胞は支持細胞(撮影:神戸大学 富樫英)
(下段)接着力を示す実験測定値を一部用いて行われた数値シミュレーションの結果。


嗅上皮の数値シミュレーションの動画
嗅上皮でみられる細胞パターン形成の数値シミュレーション。左側は野生型マウスの接着分子の濃度測定値を用いた計算、右側はαN-カテニンという接着分子を阻害して、細胞間の接着力を変化させたときのシミュレーションで、いずれも実際に観察される細胞パターンを再現することが出来ています。


龍谷大学 犯罪学研究センター(CrimRC)は、下記のウェビナーを、来る4月4日(月)にオンライン開催します。
【>>お申込みフォーム】
※申込期限:開催当日17:30


犯罪学研究センター公開研究会
「鑑定人に対する損害賠償請求(民事)事件」
和歌山カレー毒物混入事件 〜裁判官は、科学者の不正を見抜くことができるのか?〜

【実施概要】
〔日 時〕2022年4月4日(月)18:00-19:30
〔形 式〕リモート(Zoom)/定員100名 ※要申込・参加無料
〔テーマ〕「和歌山カレー毒物混入事件・鑑定人に対する損害賠償請求(民事)事件」
〔報告者〕:岩井信弁護士ほか原告弁護団
〔コメンテーター〕:河合潤教授(京都大学大学院工学研究科)
〔ナビゲーター〕:石塚伸一教授(龍谷大学法学部)
〔主 催〕龍谷大学 犯罪学研究センター(CrimRC)一般社団法人刑事司法未来(CJF)

【企画の趣旨】
鑑定人による「鑑定不正」と「記者会見」が争われていた民事名誉毀損事件の判決が、2022年3月11日に大阪地方裁判所において、請求棄却の判決が言い渡されました。

判決は、鑑定について数々の問題を指摘するとともに、記者会見は違法であることを認めました。ただし、後者については時効が成立していることを理由に損害賠償の請求を棄却しました。

今回は、林眞須美原告の代理人である岩井信弁護士ほかの弁護団と、証人として2人の鑑定人の問題性について証言された河合潤京都大学教授をお招きして、研究会を開催することにしました。和歌山カレー毒物混入事件や法と科学の問題に関心をお持ちの方は、奮ってご参加ください。
─────────────────
【参考資料】
河合潤著『鑑定不正ーカレーヒ素事件』(日本評論社、2021年)

※上記出版に際して、2021年9月に2回にわたり公開研究会を実施しました。下記、レポートまたは記録映像を参照ください。
【河合潤教授(京都大学)に聞く】和歌山カレー事件と『鑑定不正』連続研究会 開催レポート
https://www.ryukoku.ac.jp/nc/news/entry-9357.html

備考:
・Zoomの視聴情報は、お申し込みフォームに入力いただいたメールアドレスに、【開催当日】にメールで連絡します。Zoom情報を、他に拡散しないようお願いいたします。
また、申し込み名とZoomの名前を合わせていただくようにお願いいたします。

・2022年3月11日大阪地方裁判所の判決資料については、近日中にTKCローライブラリーの判例検索で参照できるようになります。


入学予定者 各位

この度はご入学おめでとうございます。

本学の一部の学部では、1年生の英語科目の履修にあたり、教育効果の向上の一助として入学時に実施する「英語プレイスメントテスト」の成績をもとに、習熟度別クラス編成を行っています。このプレイスメントテストは、インターネットに接続されたパソコンで実施するテストとして、以下の学部にご入学予定の方を対象に受験いただいています。

  (対象学部)
   文学部・経済学部・経営学部・法学部・政策学部
   先端理工学部・社会学部・農学部
    ※国際学部・短期大学部へご入学予定の方は、本案内の対象ではありません。

上記の対象学部にご入学予定の方には随時、テスト受験のご案内を郵送しておりますが、お手元に届いていない方は以下の「受験のしおり」をご確認いただき、3月31日(木)までにご受験いただきますようお願いいたします。

  <受験のしおり>※ご入学予定の学部によって内容が異なります。
    ・対象学部:文学部・経済学部・経営学部・法学部・政策学部
    ・対象学部:先端理工学部・社会学部・農学部

なお、ご不明点等がございましたら、「受験のしおり」に記載の【□お問い合わせ先□】にご連絡ください。
 


 関西経済同友会 スポーツ・健康委員会(委員長=水野明人氏 ミズノ(株)代表取締役社長)主催の第3回講演会・意見交換会が2022年3月4日(金)に開催され、経営学部スポーツサイエンスコース松永敬子教授と若者を代表して松永ゼミ生5名(2~4年生)が招かれました。同委員会主催の講演会・意見交換会において、大学生が招待されるのは初めてのことで、名誉なことであると同時に非常に貴重な経験となりました。
 講演会では「地域スポーツの現状とイノベーションの可能性」について、松永教授が講話。続いて、地域の問題・課題を解決するために、健康・スポーツの視点からアプローチし、地域活性化を促進する関係性を創出する仕組みづくりを実践するスポーツサイエンスコース松永ゼミ生からの「スポーツマネジメントとダイバシティ」に関するショートプレゼンテーションを受けて、スポーツ・健康委員会メンバーの皆さまなどと意見交換を行いました。
 松永ゼミ生のプレゼンに対して、「社員にもぜひ今回のプレゼンを聴かせたかった」という嬉しいコメントをいただいたり、「視点を変える、視点を広げることの重要性」を指摘していただいたりするなど、ゼミ生にとって大きな刺激になりました。また、海外留学経験のあるゼミ生からは、海外の若者のSNS事情などについても情報提供がなされました。地域スポーツとイノベーションにおける企業の関りについても、今後の課題としていただくなど、実り多い有意義な時間となりました。


■スポーツサイエンスコース松永ゼミ生 ショートプレゼンのテーマ
「スポーツマネジメントとダイバシティ」

 ①    経営学部3年赤嶺咲希さん(松永ゼミ長)
  「スポーツサイエンスコーススポーツマネジメント研究室松永ゼミ紹介」
 ②    経済学部4年大志万侑也さん
  (2020 年度WMGインターカレッジコンペティションリーダー)
  「過疎地域の子どもたちと訪日外国人によるスポーツを通じた国際交流」
   https://www.ryukoku.ac.jp/nc/news/entry-6917.html
 ③    経営学部2年髙橋穂輝さん
  (2021年度WMGインターカレッジコンペティションリーダー)
  「Let's enjoy sports in KANSAI ~外国人誘致と地域活性化~」
 ④    経営学部3 年竹本美咲さん
  (2021 年度WMGインターカレッジコンペティションリーダー)
  「妊産婦・子育て世代の方々とスポーツでリフレッシュ!」
 ⑤    経営学部3年所沙夜さん
  (2021年度日本スポーツ産業学会第30回大会アイディアコンペリーダー)
  「野球場の車いすエリアのリノベーション」
   https://www.ryukoku.ac.jp/nc/news/entry-8988.html


経営学部3年所沙夜さん


経済学部4年大志万侑也さん

●スポーツサイエンスコース松永ゼミ参加メンバーコメント
経済学部4年・大志万侑也さん
 松永ゼミでの学びをプロジェクトとして推進している内容について、多種多様な企業の役員様方にフィードバックを頂き、より現実的なご意見を知る事ができました。
 今後は、今まで以上に、様々な企業様と松永ゼミが連携して日本のスポーツ界に良い影響を与えられる様なプロジェクトを築く為に、今回のご意見を活かしたいと思いました。


経営学部3年・赤嶺咲希さん
 今年度、本格的にゼミ内プロジェクトが進み、コロナ禍でも取り組める活動の機会が増えました。企業の経営層の方々との意見交換の場では、我々のアイデアに対して新たな提案や課題の提示を頂きました。特にゼミでの活動の実現性を目の当たりにできたことが一番の収穫でした。自身としてはより一層スポーツマネジメントを深く学び社会に貢献出来る活動をし、後輩が繋ぐ松永ゼミの活動をより活発化させたいと考えています。

経営学部3年・竹本美咲さん
 私たち松永ゼミ生がダイバーシティの考えをもとに、コンペティションで提案した内容から出てきた、今後の課題点や改善点を多種多様な企業の役員の方々の前でお話させていただきました。私たちの考えを伝えるだけでなく、企業の皆さまからの課題解決に向けたご意見をいただくことができ、全てにおいて勉強になることばかりで、非常に貴重な体験ができたと考えております。

経営学部3年・所 沙夜さん
 私は2021年7月に出場した日本スポーツ産業学会アイデアコンペでの「車いす席エリアのリノベーション」という提案のために行ったヒアリングの内容やそこから判明した現状と改善すべき課題点、そして提案を実現するために、企業にはどのようなサポートを求めるのかということを自分なりに考え、企業の皆様に伝えることができました。これから企業がどう変わっていくべきなのか、経営者の方々からの生の声を聞かせていただくことができ、大変勉強になりました。

経営学部2年・髙橋穂輝さん
 関西を代表する会社の経営者の方々と意見交換をするという、またとない機会でしたので志願して参加させていただきました。今の自分には無い、出来ないモノの考え方や捉え方、地域スポーツなど様々な問題に対する意見を聴き、学ぶことが出来て、とても素晴らしい経験になりました。今回の経験を、ゼミをはじめとする色々な活動に活かしていき、また、自分のスポーツに対する考えや意見を深めていきたいです。


関西経済同友会 スポーツ・健康委員会委員長 水野明人氏( ミズノ(株)代表取締役社長)と松永ゼミ生


2021年度関西経済同友会 スポーツ・健康委員会


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